Optimización de la técnica SSCP-HD para la detección de polimorfismos en el exón 3 del gen ADIPOQ

Contenido principal del artículo

María del C. González Giménez
María M. Tiscornia
Romina Hahn
Pedro D. Zapata
Graciela A. Bonneau

Resumen

Los polimorfismos del gen de la adiponectina están relacionados con alteraciones en su expresión con la subsecuente disminución en los niveles plasmáticos de adiponectina, esto último se encuentra asociado a la insulino-resistencia, obesidad e hipertensión arterial, todos factores de riesgo para enfermedades cardiovasculares y oncológicas. El objetivo del trabajo fue estandarizar una reacción de amplificación, PCR, seguida de detección mediante SSCPHD (polimorfismo de conformación de cadena simple-heterodúplex) para el análisis de los polimorfismos de simple nucleótido (SNPs) presentes en el exón 3 del gen ADIPOQ. Las extracciones de ADN se realizaron por el método Salting-Out modificado, los cebadores fueron analizados mediante programas bioinformáticos, y los fragmentos obtenidos fueron analizados mediante la técnica de Polimorfismo en la Cadena Simple-Heterodúplex (SSCP-HD). Con las condiciones utilizadas se logró la amplificación del exón 3 de ADIPOQ, identificándose patrones de corridas mediante la técnica de SSCP-HD que facilitarán el estudio posterior de los polimorfismos de simple nucleótido en el gen seleccionado.

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Detalles del artículo

Cómo citar
González Giménez, M. del C., Tiscornia, M. M., Hahn, R., Zapata, P. D., & Bonneau, G. A. (2012). Optimización de la técnica SSCP-HD para la detección de polimorfismos en el exón 3 del gen ADIPOQ. Revista De Ciencia Y Tecnología, 18(1), 12–16. Recuperado a partir de https://www.fceqyn.unam.edu.ar/recyt/index.php/recyt/article/view/466
Sección
Biología y Genética

Citas

Elissondo, N.; Gómez Rosso, L.; Maidana, P. y Brites, F., Adiponectina: una adipocitoquina con múltiples funciones protectoras., Acta Bioquím Clín Latinoam. 42: p 17-33. 2008.

Maeda, K.; Okubo, K.; Shimomura, I.; Funahashi, T.; Matsuzawa, Y. y Matsubara, K., cDNA cloning and expression of a novel adipose specific collagen-like factor,apM1 (AdiPose Most abundant Gene transcript 1)., Biochem Biophys Res Commun. 221: p 286-289. 1996.

Scherer, P.; Williams, S.; Fogliano, M.; Baldini, G. y Lodish, H., A novel serum protein similar to C1q, produced exclusively in adipocytes. J BiolChem. 270: p 26746-26749.1995.

Hu, E.; Liang, P. y Spiegelman, B., AdipoQ is a novel adipose- specific gene dysregulated in obesity. J Biol Chem. 271: p 10697-10703.1996.

Nakano, Y.; Tobe, T.; Choi-Miura, N.; Mazda, T. y Tomita, M., Isolation and characterization of GBP28, a novel gelatin-binding protein purified from human plasma. J Biochem. 120: p 803-812. 1996.

Takahashi, M.; Arita, Y.; Yamagata, K.; Matsukawa, Y.; Okutomi, K.; Horie, M.; Shimomura, I.; Hotta, K.; Kuriyama, H.; Kihara, S.; Nakamura, T.; Yamashita, S.; Funahashi, T. y Matsuzawa, Y., Genomic structure and mutations in adipose-specific gene, adiponectin. Int J Obes Relat Metab Disord. 24: p 861-868. 2000.

Waki, H.; Yamauchi, T.; Kamon, J.; Ito, Y.; Uchida, S.; Kita, S.; Hara, K.; Hada, Y.; Vasseur, F.; Froguel, P.; Kimura, S.; Nagai, R. y Kadowaki, T., Impaired multimerization of human adiponectin mutants associated with diabetes. Molecular structure and multimer formation of adiponectin. J BiolChem. 278: p 40352-40363. 2003.

Hara, K.; Boutin, P.; Mori, Y.; Tobe, K.; Dina, C.; Yasuda, K.; Toshimasa, Y.; Shuichi, O.; Terumasa, O.; Kazuhiro, E.; Hiro, K.; Ryoko, H.; Yasuo, A.; Yoshio, Y.; Ryozo, N.; Matsuo, T.; Koichi, M.; Madoka, Y.; Yasuko, N.; Satoshi, K.; Motowo, T.; Satoshi, K.; Chikako I.; Philippe, F. y Takashi, K., Genetic variation in the gene encoding adiponectin is associated with an increased risk of type 2 diabetes in Japanese population. Diabetes. 51: p 536-540. 2002.

Takashi, K.; Toshimasa, Y.; Naoto, K.; Kazuo, H.; Kohjiro, U y Kazuyuki, T., Adiponectin and adiponectin receptors in insulin resistance, diabetes, and the metabolic syndrome. The Journal of Clinical Investigation. 116: p 1784-1792. 2006.

Lopez Fontana, C.M.; Maselli Artola, M.E.; Di Milta Monaco, N.; Recalde Rincon, G.M.; Vanrell Rodriguez, M.C.; Uvilla Recupero, A.; Messina Lombino, D.; Perez Elizalde, R.F.; Lopez Laur, J.D. Influencia de la leptina y adiponectina sobre el cáncer de próstata. Arch Esp Urol. 62:103-108. 2009.

Cook, J. y Semple, R., Hypoadiponectinemia—Cause or Consequence of Human “Insulin Resistance”?. J Clin Endocrinol Metab. 95: p 1544-1554. 2010.

Vasseur, F.; Helbecque, N.; Dina, C.; Lobbens, S.; Delannoy, V.; Gaget. S.; Boutin. P.; Vaxillaire, M.; Lepretre, F.; Dupont, S.; Hara, K.; Clement, K.; Bihain, B.; Kadowaki, T. y Froguel, P., Single-nucleotide polymorphism haplotypes in the both proximal promoter and exon 3 ofthe Apm1 gene modulate adipocyte-secreted adiponectin hormone levels and contribute to the genetic risk for type 2 diabetes in French Caucasians. Human Molecular Genetics. 11: 2607-2614. 2002.

Cuzcano Estrada, A.; Sandoval, J.; Guevara Fujita, M. y Fujita R., Uso de la técnica del SSCP para detectar mutaciones puntuales del ADN mitocondrial humano. Rev. peru. Biol. 12: p 349- 358. 2005.

Miller, S.; Dykes, D. y Polesky, H., A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nuc. Ac. Res. 16 : p 1215.1988.

Howard Hughes Medical Institute and National Institutes of Health, National Human Genome Research Institute; http://frodo.wi.mit.edu/cgibin/primer3/primer3_www.cgi. (verified 02 Oct. 2011)

Canovas, F.; Gallardo, A.; Avila, C. y Claros, M., Bioquímica Aplicada. Diseño experimental y análisis de datos. Asturias. Septem Ediciones. p 294. 2001

Sheffield, V.; Beck, J.; Kwitek, A.; Sandstrom, D. y Stone, E., The sensitivity of single strand conformation polymorphism analysis for detection of single base substitutions. Genomics 16: p 325-332. 1993.

Kakavas, V.; Plageras, P.; Vlachos, T.; Papaioannou, A. y Noulas, V., PCR–SSCP: A Method for the Molecular Analysis of Genetic Diseases. Mol Biotechnol. 38: p 155–163. 2008.

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